بالنسبة لتنظيم القاعدة كانت طالبان ذات يوم حليفًا عندما كانت أفغانستان تحت حكم الرئيس برهان الدين رباني الذي كان مدعومًا من الولايات المتحدة وحلف شمال الأطلسي. وبدعم من تنظيم القاعدة تمكنت طالبان من هزيمة نظام الرئيس برهان الدين رباني. فلذلك إذا عاد تنظيم القاعدة الآن إلى أفغانستان فإن إمارة أفغانستان الإسلامية سترحب به بأيدي مفتوحة.
من الممكن منع عودة تنظيم القاعدة إلى أفغانستان واحتمال التعاون مع إمارة أفغانستان الإسلامية إذا رفع المجتمع الدولي العزلة على إمارة أفغانستان الإسلامية واعترف بها كحكومة ذات سيادة.
